CT:n liittäminen suojareleen eroaa mittaussovelluksista useilla tärkeillä tavoilla. Suojareleet vaativat CT:itä, joilla on tietyt tarkkuusluokat ja jotka on suunniteltu toimimaan lineaarisesti vikatilanteissa, jolloin ensiövirrat voivat olla monta kertaa nimellisarvot. CT-toisiojohto on kytkettävä releen virrantuloliittimiin oikealla napaisuudella, jotta varmistetaan oikea suunta- ja differentiaalisuojaus.
Toissijaiset liitännät S1 ja S2 tulee kytkeä releliitäntöihin, jotka on merkitty piirikaaviossa k ja l vastaavasti-. Differentiaalisuojausjärjestelmissä napaisuuden kohdistus on kriittinen. Suojatun laitteen molemmille puolille tulevat virrat on otettava huomioon niiden suunnan suhteen. Kun vika ilmenee varsinaisessa toiminnassa, releen tulee pystyä erottamaan sisäiset viat ja läpimenohäiriöt, ja tämä erottelu riippuu täysin oikeasta CT-napaisuudesta ja kytkennästä.
Muuntajan differentiaalisuojauksessa CT:iden kytkennän tulee ottaa huomioon tehomuuntajan käämikokoonpanon aiheuttama vaihesiirto. Jos ensiömuuntajan käämi on kolmio{1}}kytketty, ensisijaiset CT:t on tyypillisesti kytketty tähtiin; jos toisiomuuntajan käämi on tähti-kytketty, toisio-CT:t on kytketty kolmioon. Tämä kompensoi 30 asteen vaihesiirtoa ja varmistaa, että releeseen tulevat virrat ovat samassa vaiheessa normaaleissa olosuhteissa-. Monimutkaisemmissa tilanteissa voidaan käyttää ulkoisia välivirtamuuntajia (ICT) vaaditun suhteen ja vaiheen korjauksen saavuttamiseksi.
Maasulkusuojausjärjestelmät perustuvat myös tiettyihin CT-liitäntöihin. Suora välitys voi tarjota maadoitettua -vaihesuojaa käyttämällä CT:tä, jonka suhde on esimerkiksi 50/5 tai 10/1. Tasapainovuon välitys havaitsee maadoitettua -vaihevirtaa käyttämällä kolmivaihejohtimen ympärille asennettua donitsi-tyyppistä CT:tä, jossa virtojen summan pitäisi normaalisti olla nolla. Jäännöslaukaisurele käyttää kolmivaiheisista CT:istä johdettua vikavirtaa.
Suojausjärjestelmästä riippumatta pätevät samat perusturvasäännöt: CT-toisioyksikköä ei saa koskaan jättää auki, kun ensiövirta kulkee, ja toisiopiiri on maadoitettava yhdessä pisteessä. Ennen kaapelointia CT-toisioyksikkö tulee katkaista-sulkemalla se oikosulkulohkon kautta. Kaikki ulkoisen virtamuuntajan toisiokäämit on maadoitettu maadoitusväylään, eikä CT-toisiokäämiä saa missään tapauksessa jättää auki-, kun ensiövirta kulkee. Tarkista asennuksen jälkeen napaisuus tarkkailemalla releen mitattuja virtoja kuormituksen alaisena tai käyttämällä vaihe--kulmamittaria käyttöönoton aikana.